De älskande i San Fernando är en verklighetsberättelse om unga drömmar, kärlek och den framtid som sedan blev. Filmen utspelas i den lilla byn San Fernando i Nicaragua och börjar i ljusa färger.

Kriget har plågat landet med nu är befrielsen här och kärleken spirar mellan Ninoska och Tinoko. Sedan följer en tidresa som inte slutar förran vid millenieskiftet. Vi följer Ninoska och Tinoko genom åren, hur Tinoco slutligen vinner brödernas och föräldrarnas förtroende och får gifta sig med Ninoska, deras kamp för överlevnad i fattigdomen, hur de flyttar till kusten för att skapa en trygghet för sig och sina barn, och hur de återkommer efter att ha misslyckats.Ninoska drömmer om frihet och oberoende, om att skaffa sig en utbildning. När filmen börjar är hon tretton år, på millenienatten då de sista bilderna tas har hon en egen dotter på tretton.